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ICAN Omics lipidomics

Des technologies de pointe telles que la spectrométrie de masse couplée à la chromatographie gazeuse ou liquide nous permettent de garantir des analyses quantitatives et ultra-sensibles sur des centaines d’espèces lipidiques dans diverses matrices biologiques.



Expertises et services
1. Profilage complexe par LC-ESI-MS/MS
- Glycerophospholipides (238): PC, LPC, PE, LPE, PE plasmalogen, PI, PG, LPG, BMP, PS, PA
- Sphingolipides (70): Sphingomyelin (SM), ceramides, dihydroceramide (DHC), acylceramides
- Lipides neutres (135) : TAG, DAG, MAG, CE, cholesterol
2. Approche ciblée en vue d’études de voies métaboliques précises (LC-MS/MS et GC-EI/CI-MS)
- Métabolites issus du microbiote: stanols (coprostanol, epicoprostanol, ethylcoprostanol), acides biliaires (primaires, secondaires, conjugués)
- Acides gras libres (FFA) (27 lipides): 15:0, 16:0, 16:1, 17:0, 18:0, 18:1, 18:2, 18:3 (w3 et w6), 20:0, 20:1, 20:2, 20:3 (w3 et w6), 20:4, 20:5, 22:0, 22:1, 22:4, 22:6, 23:0, 24:0, 24:1
- Voie de synthèse du cholesterol: squalene, lanosterol, desmosterol, lathosterol, cholesterol
- Marqueurs d’absorption intestinale: phytosterols (campesterol, β-sitosterol, stigmasterol), cholestanol
Matrices : Biofluides (plasma, serum, lipoproteines (VLDL, LDL HDL)), feces, tissu (foie, tissu adipeux, cerveau, cœur, muscle), autres (exosomes, mitochondries, cellules, bactéries…)
Équipements sur la plateforme
- GC-MS : Trace 1310/ISQ LT (ThermoFisherScientific)
- LC-MS/MS: HPLC (Prominence Shimadzu)/ QTrap 4000 (AB Sciex)
- Automate pré-analytique LV200 (Biotage)
- Homogénéisateur Precellys Evolution (Ozyme),
- Manifold à pression positive (Waters positive pressure manifold – 96)
- Concentrateur speed vacuum SPD131DDA avec piège cryogénique (Thermo Fisher Scientific).

Développements en cours
- Sphingosines, sphingosine-1-Phosphate
- Oxystérols
Rayonnement d’interaction de la plateforme lipidomics
- Education : plateforme référence du parcours OMICS du master Biomics de Université Paris Est Créteil
Réseaux locaux : UMS RésOmique SU
Réseaux nationaux : MetaboHub, RFMF, Lipidomystes, Consortium Microbiote INSERM
Réseaux internationaux : ELM, MPF, metabomeeting, european regional metabolomics networks
Certifications
Label IBiSA obtenu en 2020 (https://www.ibisa.net/plateformes/icanomics-635.html)
Équipe
Marie Lhomme (IR, ICAN)
Responsable opérationnel
Dr Anatol Kontush (DR, UMR ICAN 1166)
Directeur scientifique
Maharajah Ponnaiah (IR, ICAN)
Data Scientist
Sora Lecocq (Tech, ICAN)
Technicien
Comité scientifique
Pr. F.Mochel (ICM)
Dr F.Lamari (APHP)
Dr GI Boneca (Pasteur)
Dr F.Fenaille (CEA)
Wilfried Le Goff (UMR ICAN 1166)
Contact
Conditions d'accès
- Téléchargez le formulaire ci-dessous et renvoyez à m.lhomme@ihuican.org
- Votre projet sera soumis au comité de pilotage
- Après validation, devis établi et projet initié