ICAN Omics lipidomics

Des technologies de pointe telles que la spectrométrie de masse couplée à la chromatographie gazeuse ou liquide nous permettent de garantir des analyses quantitatives et ultra-sensibles sur des centaines d’espèces lipidiques dans diverses matrices biologiques.

Expertises et services

1.  Profilage complexe par LC-ESI-MS/MS

Glycerophospholipides (238): PC, LPC, PE, LPE, PE plasmalogen, PI, PG, LPG, BMP, PS, PA
Sphingolipides (70): Sphingomyelin (SM), ceramides, dihydroceramide (DHC), acylceramides
Lipides neutres (135) : TAG, DAG, MAG, CE, cholesterol

2.  Approche ciblée en vue d’études de voies métaboliques précises (LC-MS/MS et GC-EI/CI-MS)

Métabolites issus du microbiote: stanols (coprostanol, epicoprostanol, ethylcoprostanol), acides biliaires (primaires, secondaires, conjugués)
Acides gras libres (FFA) (27 lipides): 15:0, 16:0, 16:1, 17:0, 18:0, 18:1, 18:2, 18:3 (w3 et w6), 20:0, 20:1, 20:2, 20:3 (w3 et w6), 20:4, 20:5, 22:0, 22:1, 22:4, 22:6, 23:0, 24:0, 24:1
Voie de synthèse du cholesterol: squalene, lanosterol, desmosterol, lathosterol, cholesterol
Marqueurs d’absorption intestinale: phytosterols (campesterol, β-sitosterol, stigmasterol), cholestanol

Matrices : Biofluides (plasma, serum, lipoproteines (VLDL, LDL HDL)), feces, tissu (foie, tissu adipeux, cerveau, cœur, muscle), autres (exosomes, mitochondries, cellules, bactéries…)

Équipements sur la plateforme

GC-MS : Trace 1310/ISQ LT (ThermoFisherScientific)
LC-MS/MS: HPLC (Prominence Shimadzu)/ QTrap 4000 (AB Sciex)
Automate pré-analytique LV200 (Biotage)
Homogénéisateur Precellys Evolution (Ozyme),
Manifold à pression positive (Waters positive pressure manifold – 96)
Concentrateur speed vacuum SPD131DDA avec piège cryogénique (Thermo Fisher Scientific).

Développements en cours

Sphingosines, sphingosine-1-Phosphate
Oxystérols

Rayonnement d’interaction de la plateforme lipidomics

Education : plateforme référence du parcours OMICS du master Biomics de Université Paris Est Créteil
Réseaux locaux : UMS RésOmique SU
Réseaux nationaux : MetaboHub, RFMF, Lipidomystes, Consortium Microbiote INSERM
Réseaux internationaux : ELM, MPF, metabomeeting, european regional metabolomics networks