Des technologies de pointe telles que la spectrométrie de masse couplée à la chromatographie gazeuse ou liquide nous permettent de garantir des analyses quantitatives et ultra-sensibles sur des centaines d’espèces lipidiques dans diverses matrices biologiques.

Expertises et services

1.  Profilage complexe par LC-ESI-MS/MS

  • Glycerophospholipides (238): PC, LPC, PE, LPE, PE plasmalogen, PI, PG, LPG, BMP, PS, PA
  • Sphingolipides (70): Sphingomyelin (SM), ceramides, dihydroceramide (DHC), acylceramides
  • Lipides neutres (135) : TAG, DAG, MAG, CE, cholesterol

2.  Approche ciblée en vue d’études de voies métaboliques précises (LC-MS/MS et GC-EI/CI-MS)

  • Métabolites issus du microbiote: stanols (coprostanol, epicoprostanol, ethylcoprostanol), acides biliaires (primaires, secondaires, conjugués)
  • Acides gras libres (FFA) (27 lipides): 15:0, 16:0, 16:1, 17:0, 18:0, 18:1, 18:2, 18:3 (w3 et w6), 20:0, 20:1, 20:2, 20:3 (w3 et w6), 20:4, 20:5, 22:0, 22:1, 22:4, 22:6, 23:0, 24:0, 24:1
  • Voie de synthèse du cholesterol: squalene, lanosterol, desmosterol, lathosterol, cholesterol
  • Marqueurs d’absorption intestinale: phytosterols (campesterol, β-sitosterol, stigmasterol), cholestanol

Matrices : Biofluides (plasma, serum, lipoproteines (VLDL, LDL HDL)), feces, tissu (foie, tissu adipeux, cerveau, cœur, muscle), autres (exosomes, mitochondries, cellules, bactéries…)

Équipements sur la plateforme

  • GC-MS : Trace 1310/ISQ LT (ThermoFisherScientific)
  • LC-MS/MS: HPLC (Prominence Shimadzu)/ QTrap 4000 (AB Sciex)
  • Automate pré-analytique LV200 (Biotage)
  • Homogénéisateur Precellys Evolution (Ozyme),
  • Manifold à pression positive (Waters positive pressure manifold – 96)
  • Concentrateur speed vacuum SPD131DDA avec piège cryogénique (Thermo Fisher Scientific).

Développements en cours

  • Sphingosines, sphingosine-1-Phosphate
  • Oxystérols

Rayonnement d’interaction de la plateforme lipidomics

  • Education : plateforme référence du parcours OMICS du master Biomics de Université Paris Est Créteil
    Réseaux locaux : UMS RésOmique SU
    Réseaux nationaux : MetaboHub, RFMF, Lipidomystes, Consortium Microbiote INSERM
    Réseaux internationaux : ELM, MPF, metabomeeting, european regional metabolomics networks

Certifications

Équipe

Marie Lhomme (IR, ICAN)

Responsable opérationnel

Dr Anatol Kontush (DR, UMR ICAN 1166)

Directeur scientifique

Maharajah Ponnaiah (IR, ICAN)

Data Scientist

Sora Lecocq (Tech, ICAN)

Technicien

Comité scientifique

Pr. F.Mochel (ICM)

Dr F.Lamari (APHP)

Dr GI Boneca (Pasteur)

Dr F.Fenaille (CEA)

Wilfried Le Goff (UMR ICAN 1166)

Contact

47-48 bd de l’hôpital
75013 Paris
ICAN – bât E3M – 6ème étage

Conditions d'accès

  • Téléchargez le formulaire ci-dessous et renvoyez à m.lhomme@ihuican.org
  • Votre projet sera soumis au comité de pilotage
  • Après validation, devis établi et projet initié
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